Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DKK4Q9UBT3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK4Q9UBT3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms