Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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GDE1Q9NZC3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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GDE1Q9NZC3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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GDE1Q9NZC3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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GDE1Q9NZC3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
GDE1Q9NZC3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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GDE1Q9NZC3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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GDE1Q9NZC3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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GDE1Q9NZC3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GDE1Q9NZC3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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