Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZDHHC3Q9NYG2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZDHHC3Q9NYG2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms