Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COMMD8Q9NX08 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COMMD8Q9NX08 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms