Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3EQ9NVU0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms