Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST12Q9NRB3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.2 ms