Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms