Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD3Q9H7E2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms