Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCAS3Q9H6U6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms