Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SENP3Q9H4L4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SENP3Q9H4L4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms