Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXF3Q9H4D5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXF3Q9H4D5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms