Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PARLQ9H300 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PARLQ9H300 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms