Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms