Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRCC1Q9C099 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms