Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NKX6-2Q9C056 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX6-2Q9C056 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX6-2Q9C056 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX6-2Q9C056 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX6-2Q9C056 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX6-2Q9C056 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX6-2Q9C056 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX6-2Q9C056 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX6-2Q9C056 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX6-2Q9C056 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX6-2Q9C056 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NKX6-2Q9C056 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms