Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRNKL1Q9BZJ0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms