Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY42

RTFDC1, Protein RTF2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTFDC1Q9BY42 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTFDC1Q9BY42 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms