Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VN1R3Q9BXE9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms