Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF4Q9BUZ4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF4Q9BUZ4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms