Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MTA3Q9BTC8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTA3Q9BTC8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms