Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC50A1Q9BRV3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC50A1Q9BRV3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms