Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC77Q9BR77 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms