Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CITED1Q99966 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CITED1Q99966 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CITED1Q99966 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CITED1Q99966 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CITED1Q99966 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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CITED1Q99966 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CITED1Q99966 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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CITED1Q99966 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CITED1Q99966 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CITED1Q99966 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CITED1Q99966 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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