Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
GABRG3Q99928 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRG3Q99928 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms