Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPA33Q99795 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms