Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RBBP8Q99708 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RBBP8Q99708 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms