Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP19Q99542 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms