Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRBNQ96SW2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms