Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRAMP1Q96RY5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRAMP1Q96RY5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms