Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRRC1Q96M27 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms