Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUSD3Q96L08 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUSD3Q96L08 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms