Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPGRIP1Q96KN7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms