Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms