Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LTV1Q96GA3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LTV1Q96GA3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LTV1Q96GA3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms