Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FBXO17Q96EF6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FBXO17Q96EF6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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