Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MTERF3Q96E29 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MTERF3Q96E29 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms