Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NMD3Q96D46 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NMD3Q96D46 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms