Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms