Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCE1Q969G3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms