Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSR2Q969E8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSR2Q969E8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms