Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP9XQ93008 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP9XQ93008 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms