Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBXN4Q92575 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBXN4Q92575 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms