Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATRIPQ8WXE1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms