Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf54Q8WWF1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C1orf54Q8WWF1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms