Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRIM41Q8WV44 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms