Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC12Q8WUD4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms