Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATL2Q8NHH9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL2Q8NHH9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms