Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP35Q8NFH5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms