Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPUSD2Q8IZ73 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPUSD2Q8IZ73 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms