Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KSR1Q8IVT5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KSR1Q8IVT5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms